Linder veroverde met Ajax het landskampioenschap in het seizoen 1981/82 met jonge talenten als
Frank Rijkaard, Gerald Vanenburg en
Marco van Basten. Ook zat de teruggekeerde
Johan Cruijff bij de selectie. Vanenburg kon heel goed opschieten met Linder, vertelde hij. 'Linder was echt een fijne trainer. De rust die hij uitstraalde, iedereen die het verdiende kreeg zijn kans.'
Na het seizoen 1981/82 vertrok Linder als hoofdtrainer bij Ajax. De Duitser wilde graag terug naar zijn familie in Zwitserland en keerde vervolgens terug bij zijn oude liefde Young Boys. Een aantal jaar later maakte Linder echter weer zijn rentree als hoofdtrainer bij de Amsterdamse hoofdmacht. De tweede periode van Linder bij Ajax was niet succesvol te noemen. De Duitser vertrok na een slechte seizoenstart al na enkele maanden. Zo kon Linder niet goed opschieten met jonge talenten als bijvoorbeeld
Dennis Bergkamp.
Na zijn ontslag op 20 september 1988 beëindigde Linder ook zijn carrière als trainer. Interim-trainers Kohn en
Louis van Gaal namen het roer over en eindige dat seizoen nog knap op de tweede plek achter landskampioen
PSV. 'Ajax wenst de nabestaanden van Linder veel sterkte bij de verwerking van dit verlies', aldus de Amsterdamse club.