Van Basten trad in september 2016 in dienst bij de FIFA. De Nederlander was in zijn functie onder meer nadrukkelijk betrokken bij de invoering van de video-arbitrage in het voetbal. In een persbericht vertelt Van Basten dat beide partijen in onderling overleg uit elkaar gaan. 'Na twee goede en interessante jaren heb ik besloten om te stoppen bij de FIFA. Vooral omdat ik meer bij mijn familie in Amsterdam wil zijn.'
'Ik heb veel geleerd in mijn positie', vervolgt Van Basten. 'En heb invloed kunnen uitoefenen op het spel vanaf 'de andere kant'. De introductie van de
VAR op het WK in Rusland is een mijlpaal geweest.' In het persbericht wordt ook gemeld dat Van Basten in de toekomst, in een andere functie, mogelijk weer terugkeert bij de FIFA.